รายละเอียด - ระบบฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย : ศูนย์บริการความรู้ทางวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี (STKS)

รายละเอียดวิทยานิพนธ์
ชื่อวิทยานิพนธ์	การยับยั้งการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสทอร่าด้วยกระบวนการยับยั้งการแสดงออกของยีน RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF TAURA SYNDROME VIRUS REPLICATION
ชื่อนิสิต	วรัญญา วุฒิจันทร์ Varunya Vudtijun
ชื่ออาจารย์ที่ปรึกษา	วิฑูรย์ ถิระโสภณ, Ph.D.สกล พันธุ์ยิ้ม, Ph.D.นารีรัตน์ วิเศษกุล, D.V.M., Ph.D Witoon Tirasophon, Ph.D.Sakol Panyim, Ph.D.Nareerat Viseshakul, D.V.M., Ph.D.
ชื่อสถาบัน	มหาวิทยาลัยมหิดล. บัณฑิตวิทยาลัย Mahidol University. Bangkok (Thailand). Graduate School.
ระดับปริญญาและรายละเอียดสาขาวิชา	วิทยานิพนธ์มหาบัณฑิต. วิทยาศาสตร์ (อณูพันธุศาสตร์และพันธุวิศวกรรมศาสตร์) Master. Science (Molecular Genetics and Genetic Engineering)
ปีที่จบการศึกษา	2548
บทคัดย่อ(ไทย)	กุ้งข้าวแปซิฟิก (~iPenaeus vannamei~i) เป็นสายพันธุ์กุ้งทะเลที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจในหลายประเทศทั่วโลกรวมทั้งประเทศ โรคติดเชื้อที่สำคัญของกุ้งขาวแปซิฟิกคือโรคจากไวรัสทอร่า ซึ่งที่ผ่านมาได้ทำความเสียหายอย่างมากต่ออุตสาหกรรมการเลี้ยงกุ้งทั่วโลก ในปัจจุบันนี้ยังไม่พบวิธีการรักษาหรือวัคซีนสำหรับโรคติดเชื้อไวรัสทอร่าในกุ้งทะเล ในการศึกษาครั้งนี้ได้แยกเชื้อไวรัสทอร่าจากตัวอย่างกุ้งจากแหล่งเพาะเลี้ยงกุ้งขาว 3 แห่งในประเทศไทยการวิเคราะห์ลำดับเบสและกรดอะมิโนในบริเวณที่มีการสร้างโปรตีน (open reading frame) ของยีนที่ 1(ORF1)ของไวรัสทอร่าแสดงให้เห็นว่าในบริเวณนี้ของจีโนมไวรัสมีการอนุรักษ์สูง (conserved region) มาก ลำดับเบสใน ORF1 บางส่วนถูกเลือกเป็นบริเวณเป้าหมายสำหรับการศึกษาการยับยั้งการเพิ่มาจำนวนของเชื้อไวรัสโดยเทคนิคกระบวนการยับยั้งการแสดงออกของยีนที่เรียกว่า RNAi เพื่อศึกษาถึงความเป็นไปได้ในการประยุกต์ใช้กลไก RNAiนี้ป้องกันโรคติดเชื้อจากไวรัสทอร่าในกุ้งขาวแปซิฟิก การทดลองในกุ้งขาวแปซิฟิกโดยการฉีดอาร์เอ็นเอสายคู่ที่มีลำดับเบสจำเพาะกับยีนของไวรัสทอร่า (TSV-specific dsRNA) เข้าสู่ตัวกุ้งจากนั้นติดตามาว่าสามารถยับยั้งการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสได้หรือไม่ ซึ่งพบว่ากุ้งที่ได้รับอาร์เอ็นเอสายคู่ที่มีลำดับจำเพาะกับยีนที่ไม่ใช่ยีนโปรตีนโครงสร้าง (nonstructural gene) ของไวรัสทอร่า คือ ยีน helicase protease และ polymerase ก่อนได้รับเชื้อไวรัสพบว่าระดับของเชื้อไวรัสทอร่าในกุ้งกลุ่มนี้ลดลงเมื่อเทียบกับกุ้งที่ไม่ได้รับอาร์เอ็นเอสายคู่ โดยอาร์เอ็นเอสายคู่ที่มีลำดับเบสจำเพาะกับยีน helicase ของไวรัสพบมีสามารถในการยับยั้งการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสมากที่สุด ขณะที่อาร์เอ็นเอสายคู่ที่มีลำดับเบสจำเพาะกับยีน polymerase นั้นแสดงความสามารถในการยับยั้งการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสได้น้อยที่สุด จากผลการทดลองแสดงให้เห็นว่า อาร์เอ็นเอสายคู่ที่มีลำดับเบสจำเพาะกับยีนของไวรัสทอร่าสามารถยับยั้งการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสได้ในกุ้งที่ติดเชื้อ ซึ่งสอดคล้องกับผลการทดลองของ Robalino และคณะ ที่พบว่าอาร์เอ็นเอสายคู่ทั้งที่มีลำดับเบสจำเพาะและไม่จำเพาะนั้นแสดงความสามารถในการต้านทานต่อไวรัสในกุ้งขาวได้
บทคัดย่อ(English)	Pacific white shrimp (~iPenaeus vannamei~i) is an economically important farmed penaeid shrimp speciesin many countries, including Thailand. One of the most important diseases of the white shrimp is caused byTaura syndrome virus (TSV), which has recently affected shrimp cultivation throughout the world. Atpresent, there is no known treatment or vaccine available for this viral disease. TSV were isolated from three different cultivation areas of Thailand. Analysis of nucleotide and deducedamino acid sequences in open reading frame 1 (ORF 1) of the TSV revealed that this region of the viralgenome is highly conserved with overall identity. Subregions of the ORF1 (helicase, protease and polymerase)were chosen as targets for RNAi mediated viral suppression study. The feasibility of RNAi-based techniqueto prevent TSV infection was assessed in the pacific white shrimp. Shrimps were injected with TSV specificdsRNAs, followed by virus infection. Shrimp treated with specific dsRNA targeting the nonstructural geneof TSV (ORF 1) showed a reduction in the viral level as compared with untreated shrimp. The dsRNA targetinghelicase domain exhibited the strongest inhibitory effect while the domain targeting polymerase exhibited theleast effect. Robalino ~iet al~i. found that either virus sequence-specific or nonspecific dsRNA could affordantiviral immunity in shrimp. In agreement, these results suggested that virus specific dsRNAs could suppressTSV replication in white shrimp.
ภาษาที่ใช้เขียนวิทยานิพนธ์
จำนวนหน้าของวิทยานิพนธ์	113 P.
ISBN	974-04-6843-8
สถานที่จัดเก็บวิทยานิพนธ์
คำสำคัญ	~iPENAEUS VANNAMEI~i, TAURA SYNDROME VIRUS (TSV), RNA INTERFERENCE (RNAi), DOUBLE-STRANDED RNA (dsRNA), RT-PCR
วิทยานิพนธ์ที่เกี่ยวข้อง	ผลของ Interleukin-2 ต่อการสร้าง mRNA ของ IL-2, IL-18, RANTES และMIP-1(+,a) ในผู้ป่วยติดเชื้อ HIV EFFECTS OF INTERLEUKIN-2 ON IL-2, IL-18, RANTES AND MIP-l(+,a) mRNA PRODUCTIONS 1N HIVINFECTED PATIENTS การแสดงออกของยีนของ IFN-(+,g)-inducing factor (IL-18), RANTES และMIP-1(+,a) ในผู้ป่วยที่ติดเชื้อเอชไอวีเปรียบเทียบกับคนปกติที่ไม่ติดเชื้อเอชไอวี GENE EXPRESSION OF IFN-(+,g)-INDUCING FACTOR (IL-18),RANTES AND MIP-1(+,a) IN HIV POSITIVEPATIENTS AS COMPARED TO HIV SERONEGATIVE INDIVIDUALS การตรวจหาไวรัสไข้หัดสุนัขจากตัวอย่างทางคลินิกโดยปฏิกริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส POLYMERASE CHAIN REACTION FOR DETECTION OF CANINE DISTEMPER VIRUS INCLINICAL SAMPLES การประยุกต์ใช้วิธี RT-PCR ร่วมกับการใช้เอนไซม์ตัดจำเพาะ สำหรับการวินิจฉัยโรคอหิวาต์สุกรในประเทศไทย APPLICATION OF RT'-PCR AND RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM FOR THE DIAGNOSIS OFCLASSICAL SWINE FEVER IN THAILAND การใช้ Metallothionein เป็นตัวบ่งชี้ทางชีวภาพการปนเปื้อนของปรอทในหอยแมลงภู่ ~iPerna viridis~i METALLOTHIONEIN AS BIOMARKER FOR MERCURY CONTAMINATION IN MUSSEL, ~iPerna viridis~i การโคลนและลักษณะสมบัติของ cDNA ที่เกี่ยวข้องกับการบ่งบอกเพศของกุ้งกุลาดำ~iPenaeus monodon~i CLOING AND CHARACTERIZATION OF cDNA INVOLVED IN SEX DETERMINATION OF THE GIANT TIGERSHRIMP ~iPenaeus monodon~i การตอบสนองต่อความเครียดในกุ้งกุลาดำ ~iPenaeus monodon~i โดยการตรวจวัดฮีตช็อกโปรตีนและระดับน้ำตาลในเลือด STRESS RESPONSE IN BLACK TIGER PRAWN ~iPENAEUS MONODON~i BY DETECTING HEAT SHOCK PROTEINS AND BLOOD GLUCOSE LEVEL. การพัฒนาชุดตรวจ one step multiplex RT-PCR เพื่อวินิจฉัย avian influenza A virus สายพันธุ์ H5, H7 และ H9 THE DEVELOPMENT OF ONE STEP MULTIPLEX RT-PCR ASSAY FOR H5, H7 AND H9 AVIAN INFLUENZA A VIRUS DETECTION. ระดับอาร์เอ็นเอนำรหัสของโปรตีนหลักในนมผึ้งของผึ้งโพรง ~iApis cerana~i จากผึ้งงานระยะต่างๆวิเคราะห์โดย RT-PCR. QUANTIFICATION OF mRNA LEVELS OF MAJOR ROYAL JELLY PROTEINS FROM WORKER ASIAN HIVE BEE, ~iApis~i ~icerana~i AT VARIOUS STAGES USING RT-PCR. การตรวจวินิจฉัยการติดเชื้อไวรัสแดงกีในผู้ใหญ่ด้วยวิธีการขยายสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสแดงกีจากน้ำลายและ/หรือเซลล์เยื่อบุกระพุ้งแก้ม DIAGNOSIS OF DENGUE INFECTION IN ADULT BY REVERSE-TRANSCRIPTION POLYMERASE CHAIN REACTION (RT - PCR) FROM SALIVA AND / OR BUCCAL MUCOSAL CELLS. การโคลน และการแสดงออกใน ~iEscherichia coli~i ของ cDNA สำหรับกลุ่ม เปปไทด์ฮอร์โมนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ CLONING AND EXPRESSION OF A cDNA ENCODING GROWTH-RELATED PEPTIDE HORMONE OF ~iPenaeus monodon~i IN ~iEscherichia coli~i การศึกษาความผิดปกติในกระบวนการตัดต่ออาร์เอ็นเอของยีน ~iPKD1~i ในครอบครัวคนไทย ที่เป็นโรคไตเป็นถุงน้ำแบบ AUTOSOMAL DOMINANT IDENTIFICATION OF RNA-PROCESSING ABNORMALITIES OF THE PKDI GENE IN THAI FAMILIES WITH AUTOSOMAL DOMINANT POLYCYSTIC KIDNEY DISEASE การเปรียบเทียบการแสดงออกของโปรตีนและยีนทรานสโปเสสระหว่างเชื้อ ~iBURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI~i และ ~iBURKHOLDERIA THAILANDENSIS~i COMPARISON OF PROTEIN EXPRESSION AND TRANSPOSASE GENE BETWEEN ~iBURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI~i AND ~iBURKHOLDERIA THAILANDENSIS~i การตรวจหาเชื้อไวรัสหัวเหลืองในกุ้งกุลาดำที่ไวโดยวิธี Nested RT-PCR A SENSITIVE DETECTION OF YELLOW-HEAD VIRUS (YHV) OF ~uPENAEUS MONODON~u IN BY NESTED RT-PCR AMPLIFICATION การโคลนและการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของชิ้น cDNA ของเซลล์เม็ดเลือดกุ้งกุลาดำ MOLECULAR CLONING AND SEQUENCING OF cDNAs OF BLACK TIGER SHRIMP HAEMOCYTES การใช้วิทยาการระบาดเพื่อการเฝ้าระวังการติดเชื้อไวรัสเดงกีในยุงลายจากภาคสนาม EPIDEMIOLOGICAL APPROACHES FOR SURVEILLANCE OF DENGUE VIRUS - INFECTED ~iAEDES~i MOSQUITOES IN THE FIELD การแยกและวิเคราะห์ cDNA ของไซโตโครม พี 450 จากยุงก้นปล่อง ~iANOPHELES MINIMUS~i ISOLATION OF A CYTOCHROME P450 cDNA FROM ~iANOPHELES MINIMUS~i การเหนี่ยวนำให้เกิดการสร้าง inflammatory cytokine ในเซลล์เยื่อบุผิวและเซลล์มะเร็งท่อน้ำดีเมื่อได้รับการกระตุ้นโดยแอนติเจนของพยาธิใบไม้ในตับ ~i(Opithorchis viverrini)~i INDUCTION OF INFLAMMATORY CYTOKINE EXPRESSION IN EPITHELIAL CELLS AND CULTURED CHOLANGIOCARCINOMA CELLS IN RESPONSE TO ~iOPISTHORCHIS VIVERRINI~i ANTIGEN STIMULATION การตรวจหาไวรัสไข้หวัดใหญ่ด้วยวิธี MULTIPLEX RT-PCR และการทดสอบความไวต่อยา AMANTADINE ด้วย HEMAGGLUTINATION INHIBITION ASSAY MULTIPLEX RT-PCR FOR DETECTION OF INFLUENZA VIRUS AND AMANTADINE SUSCEPTIBILITY BY HEMAGGLUTINATION INIHIBITION ASSAY การพัฒนาและความน่าเชื่อถือของวิธี NOVEL ELISA และ วิธี REAL-TIME PCR ในการทดสอบความไวของยารักษามาลาเรียชนิด ~uPLASMODIUM FALCIPARUM~u THE DEVELOPMENT AND VALIDATION OF NOVEL ELISA AND REAL - TIME PCR ~uPLASMODIUM FALCIPARUM IN VITRO~u DRUG SENSITIVITY ASSAYS การตรวจหายีนแมมมาโกลบินในกระแสเลือดของผู้ป่วยมะเร็งเต้านมในประเทศไทย MOLECULAR DETECTION OF MAMMAGLOBIN GENE IN PERIPHERAL BLOOD OF THAI BREAST CANCER PATIENTS ผลของการออกกำลังกายในหนูที่ตั้งครรภ์ต่อการเพิ่มปริมาณ BDNF mRNA ในสมองของลูกหนูบริเวณฮิปโปแคมปัส สมองส่วนหน้า และสมองน้อยรวมทั้งผลต่อการเพิ่มการเรียนรู้ของลูกหนู MATERNAL EXERCISE ENHANCES BDNF mRNA EXPRESSION IN MULTIPLE BRAIN REGIONS IN RAT PUPINCLUDING LEARNING AND MEMORY การจำแนกชนิดของยีนลูกผสมในผู้ป่วยโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิด acute lymphoblasticleukemia ในผู้ป่วยเด็ก โดยการใช้ปฏิกิริยา multiplex reverse transcription polymerasechain reaction A MULTIPLEX RT-PCR ASSAY FOR THE DETECTION OF CHIMERIC TRANSCRIPTS IN PEDIATRIC ACUTE LYPMHOBLASTIC LEUKEMIA การตรวจหาปริมาณไวรัส HIV-1 โดยเทคนิค Real-Time PCR ซึ่งใช้ Self-quenched fluorogenicprimers เป็นตัวติดตาม QUANTIFICATION OF HIV-1 BY REAL,-TIME PCR ASSAY USING SELF-QUENCHED FLUOROGENIC PRIMERS.