| รายละเอียดวิทยานิพนธ์ | |
| ชื่อวิทยานิพนธ์ | การจำแนกชนิดของเอคโตไมคอร์ไรซาในไม้ยางนาโดยใช้ลำดับเบสของ Mitochondrial Large Subunit rDNA Identification of Ectomycorrhizal Basidiomycetes of ~iDipterocarpus alatus~i Based on Mitochondrial Large Subunit rDNA |
| ชื่อนิสิต | สุภาณี เพชรแก้ว Supanee Petchkaew |
| ชื่ออาจารย์ที่ปรึกษา | ดร ทวีรัตน์ วิจิตรสุนทรกุล ดร ศันสนลักษณ์ รัชฎาวงศ์ Dr Taweerat Vichitsoonthonkul Dr Sansanalak Ratchadawong |
| ชื่อสถาบัน | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. บัณฑิตวิทยาลัย King Mongkuts University of Technology Thonburi. Bangkok (Thailand). Graduate School. |
| ระดับปริญญาและรายละเอียดสาขาวิชา | วิทยานิพนธ์มหาบัณฑิต. วิทยาศาสตร์ (เทคโนโลยีชีวภาพ) Master. Science (Biotechnology) |
| ปีที่จบการศึกษา | 2545 |
| บทคัดย่อ(ไทย) | ไม้ยางนาเป็นไม้ที่มีค่าทางเศรษฐกิจและระบบนิเวศน์ชนิดหนึ่งของประเทศไทย ไม้ยางนาเป็นไม้ที่มีราเอคโตไมคอร์ไรซาอาศัยร่วมอยู่ด้วยกับรากพืชแบบพึ่งพาอาศัย กัน พืชจะได้รับสารอาหารต่างๆ จากราทำให้พืชเจริญเติบโตได้ดีโดยเฉพาะต้นกล้า รากลุ่มนี้จึงได้รับความสนใจในการนำมาใช้ในการปลูกป่า การศึกษาประสิทธิภาพของรา ที่จะนำมาใช้จึงเป็นสิ่งจำเป็นซึ่งขึ้นอยู่กับชนิดและรูปแบบความสัมพันธ์ของสิ่ง มีชีวิตทั้งสอง ดังนั้นจึงต้องมีการจำแนกชนิดเพื่อสำรวจความหลากหลายของรา เอคโตไมคอร์ไรซาที่อาศัยอยู่ร่วมกับรากพืชในธรรมชาติ การจำแนกชนิดของรา เอคโตไมคอร์ไรซาที่อาศัยอยู่กับรากพืชยังมีข้อจำกัด เนื่องจากโดยทั่วไปมักใช้ วิธีจำแนกจากรูปร่างของรากที่เปลี่ยนแปลงไปเนื่องจากการเข้าอยู่อาศัยของราและ ดอกเห็ดที่พบบริเวณโคนต้นซึ่งพบได้ในบางฤดูกาล ซึ่งเทคนิคเหล่านี้ต้องการผู้ที่มี ความชำนาญ การพัฒนาเทคนิคทางอณูพันธุศาสตร์ช่วยให้การศึกษานี้เป็นไปได้รวดเร็ว ขึ้น งานวิจัยนี้เป็นการนำเทคนิคอณูพันธุศาสตร์มาใช้ในการจำแนกชนิดของรา เอคโตไมคอร์ไรซาในไม้ยางนาโดยใช้เทคนิค PCR ในการเพิ่มปริมาณชิ้นดีเอ็นเอที่ จำเพาะ (ML5-ML6) ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของ Mitochondrial Large subunit ribosomal DNA (mt LrDNA) แล้วจึงนำไปหาลำดับเบสเพื่อใช้เป็นข้อมูลในการเปรียบ เทียบความคล้ายคลึงกับราเอคโตไมคอร์ไรซาที่มีอยู่ในฐานข้อมูล จากการศึกษาราเอค โตไมคอร์ไรซาของรากไม้ยางนาจำนวน 26 ตัวอย่างจากสถานที่ 3 แห่ง คือ สวนพฤกษศาสตร์ 100 ปี กรมป่าไม้ เขาอ่างฤาไน จังหวัดฉะเชิงเทรา-สระแก้ว สวนพฤกษศาสตร์ภาคใต้ จังหวัดตรัง และวนอุทยานป่ากลางอ่าว จังหวัดประจวบคีรีขันธ์ เมื่อเปรียบเทียบ ลำดับเบสของ mt LrDNA จากเอคโตไมคอร์ไรซาที่อาศัยร่วมอยู่กับรากไม้ยางนากับ ข้อมูลลำดับเบสที่มีอยู่ในฐานข้อมูลพบว่าเอคโตไมคอร์ไรซาที่พบส่วนใหญ่อยู่ในวงศ์ ~iThelephoraceae~i ได้แก่ ~iTomentella~i spp. โดยราในกลุ่มนี้พบในทุกพื้นที่ ที่ทำการเก็บตัวอย่าง ราในวงศ์ ~iSclerodermaceae~i ซึ่งได้แก่ ~iScleroderma~i spp. พบรองลงมาในวนอุทยานป่ากลางอ่าว และสวนพฤกษศาสตร์ 100 ปี กรมป่าไม้ เขาอ่างฤาไนย ส่วน ~iGyroporus~i spp. พบเฉพาะที่วนอุทยานป่ากลางอ่าว จังหวัดประจวบคีรีขันธ์ เท่านั้น นอกจากนั้นยังพบราในวงศ์ ~iRussulaceae, Cortinariaceae~i และ ~iTricholomataceae~i ส่วนราในวงศ์ ~iBoletaceae~i ซึ่งได้แก่ ~iTyopilus~i sp. และ ~iLeccinum~i sp. พบในบางพื้นที่ที่ทำการเก็บ ตัวอย่าง ในการศึกษานี้ได้นำ ตัวอย่างเอคโตไมคอร์ไรซามาจำแนกชนิดโดยการนำไปวิเคราะห์ด้วย Phylogenetic analysis พบว่าให้ผลสอดคล้องกับการเปรียบเทียบลำดับเบสของ ML5-6 ทีละคู่ ข้างต้น |
| บทคัดย่อ(English) | ~iDipterocarpus alatus~i is a forest tree species, which has high economical and ecological value. ~iD. alatus~i is unusual among tropical trees in being invaded with ectomycorrhizal fungi. Ectomycorrhizae are the long life and mutual associations of fungi and fine roots, and are responsible for positive effect on plant nutrients particularly in seedlings. The potential use of ectomycorrhiza in reforestation depends on the knowledge of biological diversity and symbiotic range between these two organisms. Therefore, the species of ectomycorrhizal fungi in the forest must be identified. Prior to development of molecular techniques, identification of ectomycorrhizal fungi using root morphology and their macroscopic fruit bodies is difficult because ectomycorrhizal roots are relatively similar in appearance and their sporocarps are produced during a relatively short season each year. Molecular methods have facilitated this study. In this work, twenty-six indigenous ectomycorrhizae of ~iD. alatus~i were collected from three different forests in Thailand, ~ii.e.~i RFD Centennial Botanic Garden in Cha Choeng Sao-Sakaew province, Peninsular Botanic Garden in Trang province, and Pa Klang Ao Forest Park in Prachuap Kiri Khan province. Some portions (ML5-ML6 regious) of mitochondrial large subunit rDNA (mt LrDNA) of symbiotic fungi were amplified and sequenced. The sequences of the PCR products were compared to known sequences in GenBank to identify fungal symbionts. The results revealed that the most abundant fungi were in family ~iThelephoraceae (i.e.Tomentella~. spp.). They were distributed in all three ~iD. alatus~i forests. Fungi in family ~iSclerodermaceae (i.e.Scleroderma~i spp.) were subdominant group found in RFD Botanic Garden and Pa Klang Ao Forest Park. Whereas ~iGyroporus~i spp. were found only in Pa Klang Ao Forest Park. Only few samples were infected by fungi in family ~iRussulaceae, Cortinariaceae~i and ~iTricholomataceae.~i Mushrooms in family ~iBoletaceae (e.g.Tyopilus~i sp. and ~iLeccinum~i sp.) were also identified in some ectomycorrhizal roots. The results of identification of unknown ectomycorrhizae by placement in phylogenetic tree corresponded well with the results from paiwise sequence comparison. |
| ภาษาที่ใช้เขียนวิทยานิพนธ์ | |
| จำนวนหน้าของวิทยานิพนธ์ | |
| ISBN | |
| สถานที่จัดเก็บวิทยานิพนธ์ | |
| คำสำคัญ | Ectomycorrhizal fungi, ~iDipterocarpus alatus~i, Mitochondrial Large Subunit Ribosomal DNA, Phylogenetic Analysis, เอคโตไมคอร์ไรซา, ไม้ยางนา, mitochondrial large subunit ribosomal DNA, Phylogenetic analysis |
| วิทยานิพนธ์ที่เกี่ยวข้อง |
|
